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O CDC confirma que COVID-19 foi detectado nos EUA já em janeiro

CDC confirma que coronavírus foi detectado já em janeiro
CDC confirma que coronavírus foi detectado já em janeiro

De 21 de janeiro a 23 de fevereiro de 2020, agências de saúde pública detectaram 14 casos de doença coronavírus nos Estados Unidos em 2019 (COVID-19), todos relacionados a viagens da China (1,2). O primeiro caso nos Estados Unidos não relacionado a viagens foi confirmado em 26 de fevereiro em um residente da Califórnia que adoeceu em 13 de fevereiro (3). Dois dias depois, em 28 de fevereiro, um segundo caso não relacionado a viagens foi confirmado no estado de Washington (4,5). O exame de quatro linhas de evidência fornece uma visão sobre o momento da introdução e transmissão precoce do SARS-CoV-2, o vírus que causa o COVID-19, para os Estados Unidos antes da detecção desses dois casos.

Em primeiro lugar, a vigilância sindrômica com base nos registros do departamento de emergência de condados afetados no início da pandemia não mostrou um aumento nas visitas para doenças semelhantes a COVID-19 antes de 28 de fevereiro. Em segundo lugar, teste de SARS-CoV-2 retrospectivo de aproximadamente 11,000 amostras respiratórias de vários Locais nos EUA a partir de 1º de janeiro não identificaram resultados positivos antes de 20 de fevereiro. Terceiro, a análise de sequências de RNA viral de primeiros casos sugeriu que uma única linhagem de vírus importada direta ou indiretamente da China começou a circular nos Estados Unidos entre 18 de janeiro e 9 de fevereiro. por várias importações de SARS-CoV-2 da Europa.

Finalmente, a ocorrência de três casos, um em um residente da Califórnia que morreu em 6 de fevereiro, um segundo em outro residente do mesmo condado que morreu em 17 de fevereiro e um terceiro em um passageiro não identificado ou membro da tripulação a bordo de um navio de cruzeiro do Pacífico que partiu São Francisco, em 11 de fevereiro, confirma a circulação críptica do vírus no início de fevereiro. Esses dados indicam que a transmissão sustentada na comunidade começou antes da detecção dos dois primeiros casos não relacionados a viagens nos EUA, provavelmente resultante da importação de uma única linhagem de vírus da China no final de janeiro ou início de fevereiro, seguida por várias importações da Europa. O surgimento generalizado de COVID-19 nos Estados Unidos após fevereiro destaca a importância de sistemas de saúde pública robustos para responder rapidamente às ameaças infecciosas emergentes.

Vigilância Sindrômica

Por meio do Programa Nacional de Vigilância Sindrômica, as agências de saúde pública dos EUA recebem dados em tempo real dos departamentos de emergência em aproximadamente 4,000 unidades de saúde em 47 estados dos EUA e no Distrito de Columbia. Em 14 condados com casos iniciais de COVID-19 adquiridos na comunidade, nenhum aumento substancial foi observado na proporção de doenças semelhantes a COVID-19 (febre e tosse ou falta de ar ou dificuldade para respirar, ou a listagem de um código de diagnóstico de coronavírus) antes de 28 de fevereiro.

Vigilância para infecção aguda por SARS-CoV-2 O Seattle Flu Study (5) começou a monitorar doenças respiratórias agudas na área metropolitana de Seattle em novembro de 2018. No final de fevereiro de 2020, o estudo começou a testar amostras usando transcrição reversa-reação em cadeia da polimerase (RT- PCR) teste para SARS-CoV-2. O primeiro resultado laboratorial positivo para SARS-CoV-2 foi detectado em 28 de fevereiro a partir de uma amostra coletada em 24 de fevereiro. Após essa detecção, as amostras não identificadas coletadas anteriormente foram testadas retrospectivamente para o vírus. Não houve resultados positivos entre 5,270 amostras respiratórias coletadas durante 1 de janeiro a 20 de fevereiro (5) (T. Bedford, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, Washington, comunicação pessoal, 6 de maio de 2020). A primeira amostra com teste positivo entre essas amostras testadas retrospectivamente foi coletada em 21 de fevereiro. Durante a semana que começou em 21 de fevereiro, oito de 1,255 amostras (0.6%) deram resultado positivo e, durante a semana seguinte, 29 de 1,862 (1.6%) amostras testadas positivo. Duas redes de estudos de eficácia de vacina contra influenza com locais em seis estados (Michigan, Pensilvânia, Tennessee, Texas, Washington e Wisconsin) testaram retrospectivamente amostras respiratórias de pacientes com doença respiratória aguda para SARS-CoV-2 por RT-PCR. No site de Washington, nenhuma das 497 amostras coletadas entre 19 de janeiro e 24 de fevereiro deu resultado positivo; a primeira amostra com teste positivo foi coletada em 25 de fevereiro. Nos cinco outros locais (Ann Arbor e Detroit, Michigan; Pittsburgh, Pensilvânia; Temple, Texas; Marshfield, Wisconsin; e Nashville, Tennessee), nenhuma das 2,620 amostras coletadas durante janeiro 19 a 29 de fevereiro teste positivo para SARS-CoV-2. Em 22 de maio de 2020, quatro (<0.2%) de aproximadamente 3,000 amostras coletadas de crianças e adolescentes com idade <18 anos inscritos na New Vaccine Surveillance Network † durante 1 de janeiro a 31 de março tiveram resultados positivos para SARS-CoV-2. O primeiro resultado positivo foi de uma amostra coletada em 20 de março em Seattle.

Análise filogenética

A análise da diversidade genômica de SARS-CoV-2 de primeiros casos de COVID-19 da área de Seattle descobriu que a maioria dos vírus pertencia a um único clado (o clado do Estado de Washington), cujo ancestral comum mais recente foi estimado ter existido entre aproximadamente 18 de janeiro e 9 de fevereiro (estimativa pontual = 1º de fevereiro) .§ A sequência genômica prevista desse vírus progenitor era consistente com a do primeiro caso americano de COVID-19 importado, que ocorreu em um homem que chegou em Seattle vindo de Wuhan, China , em 15 de janeiro e adoeceu 4 dias depois. No entanto, também é possível que o clado do estado de Washington tenha surgido de um vírus com uma sequência semelhante ou idêntica de outra pessoa com infecção por SARS-CoV-2. Análises de vírus na Califórnia e no nordeste dos Estados Unidos de fevereiro a meados de março sugeriram que houve várias importações de vírus, principalmente da Europa, seguidas pela transmissão do vírus dentro dos Estados Unidos.

Casos Conhecidos em Pessoas Sem Histórico de Viagem Relevante

Antes de 26 de fevereiro Dois casos notáveis ​​de COVID-19 ocorreram no condado de Santa Clara, Califórnia: um em uma mulher que adoeceu em 31 de janeiro e morreu em 6 de fevereiro e outro em um homem não parente que morreu em casa entre 13 e 17 de fevereiro. Nenhum deles havia viajado internacionalmente nas semanas anteriores à morte. O ARN do SARS-CoV-2 foi detectado por teste RT-PCR no CDC a partir de amostras de tecido post mortem destes pacientes. Essas mortes foram certificadas por um médico legista como mortes associadas ao COVID-19. A investigação desses casos está em andamento. Surtos de COVID-19 ocorreram durante duas viagens consecutivas de um navio de cruzeiro Grand Princess (7). A sequência genômica de vírus desses surtos estava dentro do clado do estado de Washington, sugerindo que um passageiro ou membro da tripulação infectado com o vírus estava a bordo do navio quando ele deixou o porto de San Francisco em 11 de fevereiro para um cruzeiro de ida e volta. A identidade dessa pessoa é desconhecida. Discussão As informações dessas diversas fontes de dados sugerem que a transmissão limitada do SARS-CoV-2 pela comunidade nos Estados Unidos ocorreu entre a última metade de janeiro e o início de fevereiro, após uma importação do SARS-CoV-2 da China. Essa importação deu início a uma linhagem, o clado do Estado de Washington, que posteriormente se espalhou por toda a área metropolitana de Seattle e possivelmente em outros lugares. Várias importações de SARS-CoV-2 da Europa ocorreram em fevereiro e março. Não se sabe quantos US infecções ocorreram durante fevereiro e março, mas a incidência geral da doença antes de 28 de fevereiro era muito baixa para ser detectada pelos dados de vigilância sindrômica do departamento de emergência. Também desconhecidas são as datas de entrada dos vírus importados nos Estados Unidos e as identidades das pessoas que os carregaram. Uma possível fonte inicial é o primeiro relatado nos EUA caso de COVID-19, ocorrido em um homem de Washington que adoeceu em 19 de janeiro após retornar de Wuhan, China, em 15 de janeiro; a sequência genômica do vírus isolado daquele homem é consistente com o fato de ele ser a possível fonte do clado do estado de Washington, embora o rigor da investigação de contato deste caso e a ausência de casos secundários identificados sejam contrários a isso (8). No entanto, relatórios publicados subsequentes indicaram que a infecção com SARS-CoV-2 é freqüentemente assintomática e que a transmissão pode ocorrer antes do início dos sintomas (9). A possibilidade de transmissão pré-sintomática levanta pelo menos três outros cenários potenciais envolvendo este caso: 1) que uma ou mais infecções assintomáticas secundárias podem ter ocorrido entre os contatos do paciente e que isso levou a uma disseminação não detectada do vírus; 2) que o homem pode ter infectado contatos antes do início dos sintomas (tais contatos não teriam sido identificados por meio da investigação de contato padrão recomendado naquele momento); ou 3) que ele e pelo menos uma outra pessoa foram infectados por outro passageiro no mesmo vôo de Wuhan, e a propagação não detectada de outras pessoas infectadas deu origem ao clado do Estado de Washington. Qual desses cenários, se houver, provavelmente nunca será conhecido. Também é possível, dada a limitada diversidade filogenética global do SARS-CoV-2 na época, que o clado do Estado de Washington tenha sido importado para os Estados Unidos por outra pessoa desconhecida na mesma época. Os resultados dos testes sorológicos não são apresentados aqui, porque a sorologia (ou seja, o teste de anticorpos para SARS-CoV-2) provavelmente é um meio relativamente insensível de detectar um vírus recém-emergente, particularmente quando as amostras foram coletadas aleatoriamente, em vez de pessoas com maior probabilidade de estarem infectadas (em contraste, por exemplo, com o teste viral de pacientes ambulatoriais ou hospitalizados com doença respiratória aguda) e porque os testes sorológicos geralmente não se aproximam da especificidade de 100%, a menos que alguma forma de teste confirmatório esteja disponível. Por exemplo, uma pesquisa sorológica hipotética na área metropolitana de Seattle (população de 3.5 milhões) conduzida após as primeiras 3,500 infecções encontraria uma soroprevalência verdadeira de 0.1%, enquanto o uso de um ensaio com especificidade de 99% seria esperado para produzir falsos positivos em 10 vezes mais amostras. No entanto, os levantamentos sorológicos são úteis para rastrear o progresso da pandemia, uma vez estabelecida, e têm a vantagem potencial de detectar todas as infecções, independentemente do perfil dos sintomas. As descobertas neste relatório estão sujeitas a pelo menos três limitações. Primeiro, os dados apresentados aqui são retrospectivos. Embora sejam geograficamente diversos, eles não podem fornecer um quadro de transmissão tão definitivo quanto estaria disponível se testes generalizados estivessem imediatamente disponíveis após a descoberta do vírus. Em segundo lugar, alguns dos estudos citados e possivelmente outros continuam a testar amostras retrospectivamente e podem encontrar casos anteriores aos apresentados neste relatório. Finalmente, a relativa homogeneidade filogenética do SARS-CoV-2 globalmente em janeiro e no início de fevereiro limitou o que poderia ser inferido da análise genômica. Poucos países evitaram a importação e disseminação sustentada de COVID-19. Nos Estados Unidos, o SARS-CoV-2 agora está circulando amplamente após várias importações da China, Europa e outros lugares. Etapas estão em andamento nos EUA sistema de saúde pública para melhorar os indicadores da atividade do SARS-CoV-2, incluindo a expansão da vigilância sindrômica entre os departamentos de emergência e o aumento da disponibilidade de testes para o SARS-CoV-2. Dada a probabilidade de que a maioria dos EUA

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O editor-chefe da atribuição é OlegSziakov